V letech 1993 až 1999 působil doc. Vaňásek na pozici přednosty Kliniky onkologie a radioterapie Fakultní nemocnice Hradec Králové. Od roku 1999 pracoval na Oddělení klinické a radiační onkologie Pardubické nemocnice, kde setrval jako primář oddělení až do roku 2019. Paralelně s funkcí primáře zastával i post vedoucího lékaře Radiologického centra Multiscan v Pardubicích.
Doc. Jaroslav Vaňásek vybudoval síť detašovaných onkologických pracovišť společnosti Multiscan v celém Pardubickém kraji. Významně se zasloužil o vznik Komplexního onkologického centra Pardubického kraje, jež řídil a v němž zaváděl inovativní léčebné postupy, např. magnetickou rezonanci pro plánování radioterapie, konformní brachyterapii nebo radioterapii karcinomu prsu v hlubokém nádechu.
Bohatou publikační činnost doc. Vaňáska zdobí např. prvoautorská publikace v prestižním červeném časopise International Journey of Radiation Oncology, Biology, Physics.